A szerves műtrágyák egyszerűen természetes növényi vagy állati eredetű forrásokból származnak. Csak azért, mert a műtrágyát organikus címkével látják el, ez nem feltétlenül jelenti azt, hogy mentes a peszticidektől vagy géntechnológiával módosított anyagoktól. Az ilyen szennyeződésektől mentesnek a terméket fel kell tüntetni tanúsított ökológiai felhasználásra. A talajjavító szerek, például a trágya és a komposzt, a Colorado Állami Egyetem kiterjesztése szerint műszakilag nem műtrágya, mivel a gyártóknak nem kell meghatározniuk a benne lévő tápanyagok minimális mennyiségét. Javítják azonban a talaj szerkezetét és a vízelvezetést, és bizonyos tápanyagokat is szolgáltatnak.
A kertészeknek mérlegelniük kell az összes műtrágya előnyeit és hátrányait.Pamutmag étkezés
A gyapotmagliszt magas nitrogéntartalmú és lassan bomlik el egy-négy hónap alatt. Általában szemcsés termékként alkalmazzák 10 font sebességgel. 1000 négyzetláb talajonként. A gyapottermesztésben sok növényvédő szert használnak, és a gyapotmagliszt gyakran rovarirtó maradványokat tartalmaz. A legtöbb genetikailag módosított.
Kukoricaglutén
A kukoricaglutént kukorica melléktermékekből nyerik, és granulátumként alkalmazzák a talajra. A bomlás során a kukoricaglutén nagy mennyiségű nitrogént bocsát ki. Ezenkívül vékony gátat képez a talaj felett, és ezzel hatékonyan elősegíti a gyomirtást. Elsősorban a gyepen használják, de a kívánt növények megjelenése után vegetáriánus kertekben is felhasználhatók. A kukoricaglutén nitrogént bocsát ki egy-négy hónapig. Jellemző alkalmazás 20 - 40 font. 1000 négyzetláb talajonként.
Halemulzió
A halak emulzióit a halak hulladékaiból készítik, és általában folyékony készítményben alkalmazzák. A halemulzió nitrogént és több mikrotápanyagot szolgáltat, és általában kevesebbet fizet, mint más állati eredetű műtrágyák, például vérliszt és csontliszt. A halemulziónak sértő illata van, de az illat néhány napon belül eloszlik. A halpor és a halliszt drágább, mint a halemulzió, de több tápanyagot is szolgáltatnak.
Hínár
A Kelp folyékony, por vagy granulált recept formájában kapható. A nitrogén, kálium vagy foszfor helyett ezek a termékek mikrotápanyagokat és növekedési hormonokat szolgáltatnak, amelyek javítják a növények növekedését és az egészséget.
Állati melléktermékek
A vágóhídi termelés melléktermékei közé tartozik a csontliszt, a vérliszt és a tolldara. A vérliszt nagyon magas nitrogéntartalmú és nem megfelelő alkalmazás esetén növényeket égethet. A csontliszt magas foszfáttartalommal rendelkezik, bár a foszfát nem biztos, hogy a növények számára elérhető, ha a talaj pH-szintje 7,0 felett van, a Colorado State University Extension szerint. A lisztkészítmények jó nitrogénszintet biztosítanak, de lassan bomlanak le. Az összes állati melléktermék-műtrágya viszonylag drága.
